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Rによる統計解析

作成者

  • 2009/04/18 桑田 賢太郎 Ubuntu対応
  • 2015/10/19 牧野 悠(情報が古かったので全面的に書き換え)

Rとは

Rは、オープンソースの統計解析ソフトです。参考書には『統計学:Rを用いた入門書』(Michael J.Crawley著、野間口謙太郎・菊池泰樹訳)などがあります。

インストール

こちらを参考にしました。

前準備

端末を起動し、以下のコマンドを実行。

$ cat /etc/lsb-release

すると、Ubuntuのバージョンが確認できる。

例
DISTRIB_ID=Ubuntu
DISTRIB_RELEASE=14.04
DISTRIB_CODENAME=trusty
DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 14.04.3 LTS"

次に、ミラーサイトの一覧「CRAN Mirrors」で現在利用できるミラーサイトを確認する。2015年10月19日現在、日本国内では以下の2つが利用可能。どちらでもよい。

http://cran.ism.ac.jp/ 	Institute of Statistical Mathematics, Tokyo
http://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/cran/ 	Yamagata University

実際のインストール作業

端末上で

$ sudo vim /etc/apt/sources.list

エディタが開いたら、上記のUbuntuのバージョンの確認を元に、それにあった次の一行を最後に追加する。

#DISTRIB_CODENAME=vividの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu vivid/

#DISTRIB_CODENAME=trustyの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu trusty/

#DISTRIB_CODENAME=preciseの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu precise/

#DISTRIB_CODENAME=lucidの場合
deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu lucid/

次に、公開鍵を登録するため、以下のコマンドを実行する。

$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9

すると、以下のように表示される。

gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
gpg: /home/haruka/.gnupg/trustdb.gpg: trustdb created
gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg:               imported: 1  (RSA: 1)

続けて

$ gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -

すると、以下のようにOKが出るはず。

OK

Ubuntuのパッケージを更新し、Rをインストール!

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base

すると

After this operation, 99.8 MB of additional disk space will be used.
Do you want to continue? [Y/n]

当然y。

WARNING: The following packages cannot be authenticated!
 r-base-core r-cran-boot r-cran-cluster r-cran-foreign r-cran-mass
 r-cran-kernsmooth r-cran-lattice r-cran-nlme r-cran-matrix r-cran-mgcv
 r-cran-survival r-cran-rpart r-cran-class r-cran-nnet r-cran-spatial
 r-cran-codetools r-recommended r-base r-base-dev r-doc-html r-base-html
Install these packages without verification? [y/N]

まだ何か聞いてくる。これもy。これで完了!

Rを起動するには、以下のコマンドを実行すればよい。

$ R
Last modified:2015/10/19 21:32:40
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